• Москва
    19° - 21°
  • Москва
    19° - 21°
  • Москва
    19° - 21°
USD ЦБ 78.86 EUR ЦБ 93.34

25.07.2025 07:28
В Мончегорске вслед за Норильском запущена система мониторинга воздуха Вслед за Норильском систему автоматического контроля качества атмосферного воздуха  официально запустили в Мончегорске.  Это важный шаг «Норникеля» в направлении повышения экологической прозрачности и улучшения уровня жизни в

25.07.2025 07:28
В Мончегорске вслед за Норильском запущена система мониторинга воздуха  Вслед за Норильском систему автоматического контро
24.07.2025 11:24
Проектный офис развития Арктики представил рейтинг устойчивого развития арктических поселков России  Проектный офис развития Арктики представил рейтинг
24.07.2025 10:06
В России выявлены случаи заражения новым вариантом коронавируса «Стратус» В РФ выявили 114 случаев заражения новым вариантом
erid:2VtzquvL47C
06.11.2019 11:51

Новосибирские ученые знают, как повысить эффективность анализа геномных экспериментов

НИА-Федерация

Биоинформатики Новосибирского государственного университета, ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН» и университета им. Мартина Лютера (Германия) создали уникальный программный комплекс, который позволит повысить эффективность анализа дорогостоящих геномных экспериментов, сообщается на официальном портале НГУ.

Как объяснили исследователи, данный комплекс предназначен для поиска в ДНК совместно встречающихся мотивов — участков, на которые «садятся» белки, управляющие считыванием закодированной в молекуле ДНК информации. Расположенные рядом мотивы, как правило, функционируют вместе, поэтому выявление таких пар позволит ученым предсказывать взаимодействия белков уже на этапе анализа последовательности ДНК, а также исследовать роль этих взаимодействий в физиологических процессах.

Работа по созданию уникального программного комплекса заняла около двух лет, сообщает «НИА Новосибирск». 

Разработка позволяет получить гораздо более детальные сведения о регуляторной роли белка на основе эксперимента по массовому секвенированию его сайтов связывания. Если ранее для заданного белка, специфично регулирующего экспрессию генов, аналогичные подходы находили с высокой достоверностью его 3-5 партнеров-белков, то с помощью новой разработки учнееы находят 10-15.

Миллионы клеток организма синтезируют белки, которые непрерывно работают: переносят кислород, защищают от вторжения чужеродных агентов, сокращают и расслабляют мышечные волокна и выполняют массу других функций. Сведения о том, где и когда должны выполняться эти действия, зашифрованы в молекуле ДНК, причем информация записана при помощи всего четырех «букв» — нуклеотидов. Нуклеотиды объединяются в «слова» — гены, и каждый ген несет в себе сведения о белке, который может с него синтезироваться. Структуру и функцию клетки определяет уникальная комбинация белков, и какой ей быть «решают» регуляторные элементы ДНК. Их структурные единицы: короткие последовательности «букв»-нуклеотидов или мотивы — опознаются белками-регуляторами (транскрипционными факторами), что приводит к запуску или, наоборот, блокированию процесса считывания генетической информации.

Чтобы найти все мотивы определенного белка-регулятора в геноме, используется дорогостоящий эксперимент, который называется ChIP-seq. Важно, что белки-регуляторы никогда не работают в одиночку: активность и специфичность каждого модулируется многочисленными партнерскими белками-регуляторами, и результат работы мотива зачастую определяется именно этими взаимодействиями. Поиск же потенциальных партнеров, как правило, сопряжен с проведением дополнительных ChIP-seq экспериментов, что многократно повышает стоимость исследования. Именно эту проблему с успехом решает новый программный комплекс.

Новосибирские ученые получили патент на свою программу, она готова к практическому применению. В последние несколько лет появились и продолжают пополняться открытые базы, насчитывающие уже несколько десятков тысяч ChIP-seq экспериментов для разнообразных типов тканей, клеток и для разных белков-регуляторов. Алгоритм сибирских ученых может использоваться для поиска новых партнеров уже известных белков-регуляторов, ключевых для выполнения важных физиологических функций организма, например, иммунного ответа.

Работа выполнялась при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований.



Важнейшие новости регионов за 25.07.2025

2025-07-25 10:38:59 / Агропредприятие Калининского района развивается в различных направлениях
НИА-Кубань
2025-07-25 10:33:10 / Средняя зарплата в Краснодаре превысила 90 тысяч рублей
НИА-Кубань
2025-07-25 10:30:22 / Новые схемы обмана и способы борьбы с ними обсудили на совещании по противодействию кибермошенничеству
НИА-Кузбасс
2025-07-25 10:26:57 / Сохраним спортивные традиции в регионе
НИА-Красноярск
2025-07-25 10:24:51 / Калининградскому «коллекционеру» штрафов ГИБДД придётся раскошелиться
НИА-Калиниград
2025-07-25 10:20:36 / Мультифункциональный центр модной индустрии создадут в Хакасии
НИА-Хакасия
2025-07-25 10:13:26 / ОАО «РЖД» доставило крупногабаритное оборудование для разработки вскрышных пород и полезных ископаемых из Красноярского края в Забайкалье
НИА-Красноярск
2025-07-25 10:11:23 / Беспилотники при ночной атаке на Сочи нарушили границы Абхазии
НИА-Кубань
2025-07-25 10:07:55 / В Канске иностранца лишили права въезда в Россию на 3 года из-за постоянных нарушений ПДД
НИА-Красноярск
2025-07-25 10:07:24 / Глава Хакасии обсудил с министром природных ресурсов республики реализацию экологических проектов
НИА-Хакасия
2025-07-25 10:06:58 / Валенки с янтарём: Янтарный комбинат покажет коллекцию одежды из солнечного камня
НИА-Калиниград
2025-07-25 09:57:03 / В Зеленогорске пройдет фестиваль настоящей дружбы для детей и подростков
НИА-Красноярск
2025-07-25 09:54:51 / Глава Карачаево-Черкесии Рашид Темрезов запустил масштабный садоводческий проект
НИА-Кубань
2025-07-25 09:52:17 / Рекордное число двойняшек родилось за сутки на Кубани
НИА-Кубань
2025-07-25 09:51:50 / Астрономы из КЧР открыли новую звезду в Млечном Пути
НИА-Кубань
2025-07-25 09:49:09 / Байк-фестиваль пройдет в ближайшие дни на курорте Архыз
НИА-Кубань
2025-07-25 09:46:05 / На улице Воровского в Мурманске откроются «Ряды»
НИА-Мурманск
2025-07-25 09:44:18 / Кубань вновь подверглась массированной атаке БПЛА со стороны киевского режима
НИА-Кубань
2025-07-25 09:44:06 / Мончегорск приглашает на фестиваль природы в Лапландском заповеднике
НИА-Мурманск
2025-07-25 09:41:48 / Поздравление Александра Ведерникова с Днем сотрудника органов следствия Российской Федерации
НИА-Байкал
Еще 165 новостей за 25.07.2025